12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1509 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1509  17 kDa surface antigen  100 
 
 		 144 aa  285  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0358  17 kDa surface antigen  53.79 
 
 		 124 aa  128  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.649032 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0065  17 kDa surface antigen  55.17 
 
 		 151 aa  114  5e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2590  17 kDa surface antigen  48.28 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4735  17 kDa surface antigen  67.42 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1430  17 kDa surface antigen  39.58 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2328  17 kDa surface antigen  42.36 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.470917  normal  0.358461 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0937  17 kDa surface antigen  57 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4981  17 kDa surface antigen  39.56 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.932821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1508  17 kDa surface antigen  58.93 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2752  17 kDa surface antigen  50.98 
 
 		 133 aa  47.8  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.575321 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4398  hypothetical protein  41.18 
 
 		 266 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.758309 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>