10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2752 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2752  17 kDa surface antigen  100 
 
 		 133 aa  254  3e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.575321 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2328  17 kDa surface antigen  54.35 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.470917  normal  0.358461 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1430  17 kDa surface antigen  43.61 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0358  17 kDa surface antigen  53.85 
 
 		 124 aa  60.1  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.649032 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1509  17 kDa surface antigen  38.46 
 
 		 144 aa  52.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0943  17 kDa surface antigen  51.11 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.843824 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4981  17 kDa surface antigen  37.35 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.932821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3687  17 kDa surface antigen  28.46 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108599  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0065  17 kDa surface antigen  51.43 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1122  17 kDa surface antigen  38.89 
 
 		 430 aa  40  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>