28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0065 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0065  17 kDa surface antigen  100 
 
 		 151 aa  302  1.0000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0358  17 kDa surface antigen  82.26 
 
 		 124 aa  189  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.649032 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1509  17 kDa surface antigen  55.17 
 
 		 144 aa  120  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2590  17 kDa surface antigen  67.74 
 
 		 124 aa  116  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1430  17 kDa surface antigen  46.09 
 
 		 132 aa  83.6  8e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0937  17 kDa surface antigen  58.95 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4735  17 kDa surface antigen  58.44 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2752  17 kDa surface antigen  58.93 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.575321 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2328  17 kDa surface antigen  45.98 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.470917  normal  0.358461 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4981  17 kDa surface antigen  31.78 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.932821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1508  17 kDa surface antigen  51.79 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0299  hypothetical protein  45.45 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01114  hypothetical protein  40.74 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2213  hypothetical protein  40.74 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2016  hypothetical protein  41.67 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246184 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2491  hypothetical protein  40.74 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000075989 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1232  hypothetical protein  40.74 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0260587  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01106  hypothetical protein  40.74 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1233  hypothetical protein  40.74 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2537  17 kDa surface antigen  40.74 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.014281  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1927  hypothetical protein  39.58 
 
 		 178 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.339305  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1311  hypothetical protein  39.58 
 
 		 179 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000260311 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1326  hypothetical protein  39.58 
 
 		 179 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000689224 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1288  hypothetical protein  39.58 
 
 		 179 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1973  hypothetical protein  39.58 
 
 		 179 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126955  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2157  hypothetical protein  39.58 
 
 		 179 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013622 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1490  hypothetical protein  38.89 
 
 		 179 aa  40.8  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309897 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2778  hypothetical protein  34.34 
 
 		 184 aa  40  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.832205  normal  0.295065 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>