20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_37220 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_37220  hypothetical protein  100 
 
 		 469 aa  920    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4552  hypothetical protein  34.25 
 
 		 454 aa  233  8.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.420738 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3507  hypothetical protein  42.29 
 
 		 419 aa  214  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0532  hypothetical protein  36.34 
 
 		 439 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0542  hypothetical protein  36.34 
 
 		 439 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0482134  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0554  hypothetical protein  36.34 
 
 		 439 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.656823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0200  hypothetical protein  35.68 
 
 		 439 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.749346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4394  hypothetical protein  34.25 
 
 		 482 aa  186  8e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10417  hypothetical protein  32.7 
 
 		 439 aa  177  4e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000130762  normal  0.910848 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0705  hypothetical protein  35.06 
 
 		 439 aa  177  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0579407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2158  secreted protein  34.35 
 
 		 477 aa  170  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3753  hypothetical protein  32.08 
 
 		 445 aa  152  8.999999999999999e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.18885  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4940  putative secreted protein  32.49 
 
 		 463 aa  137  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3061  hypothetical protein  32.24 
 
 		 433 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000314262 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2814  hypothetical protein  30.7 
 
 		 558 aa  109  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.856062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2422  putative secreted protein  34.4 
 
 		 428 aa  107  7e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0376537  normal  0.0559574 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4401  hypothetical protein  28.84 
 
 		 533 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0879683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2229  hypothetical protein  28.43 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.239901  hitchhiker  0.0000156459 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2465  hypothetical protein  28.57 
 
 		 495 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0489987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2458  hypothetical protein  27.13 
 
 		 519 aa  55.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00115564  normal  0.62035 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>