18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3061 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3061  hypothetical protein  100 
 
 
433 aa  828    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000314262 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37220  hypothetical protein  31.68 
 
 
469 aa  147  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4552  hypothetical protein  32.69 
 
 
454 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.420738 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0542  hypothetical protein  33.91 
 
 
439 aa  120  6e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0482134  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0554  hypothetical protein  33.91 
 
 
439 aa  120  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.656823  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0532  hypothetical protein  33.91 
 
 
439 aa  120  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0200  hypothetical protein  30.56 
 
 
439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.749346  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0705  hypothetical protein  29.7 
 
 
439 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0579407 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3753  hypothetical protein  30.53 
 
 
445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.18885  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10417  hypothetical protein  28.7 
 
 
439 aa  102  9e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000130762  normal  0.910848 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4394  hypothetical protein  29.17 
 
 
482 aa  96.3  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3507  hypothetical protein  29.86 
 
 
419 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4940  putative secreted protein  34.55 
 
 
463 aa  92.4  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2814  hypothetical protein  34.55 
 
 
558 aa  87.4  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.856062  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2422  putative secreted protein  34.77 
 
 
428 aa  84.3  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0376537  normal  0.0559574 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2458  hypothetical protein  33.19 
 
 
519 aa  67  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00115564  normal  0.62035 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2158  secreted protein  36.25 
 
 
477 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4401  hypothetical protein  27.91 
 
 
533 aa  54.7  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0879683  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>