17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2465 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2465  hypothetical protein  100 
 
 		 495 aa  958    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0489987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2422  putative secreted protein  36.01 
 
 		 428 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0376537  normal  0.0559574 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2814  hypothetical protein  31.84 
 
 		 558 aa  111  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.856062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4940  putative secreted protein  32.54 
 
 		 463 aa  94.4  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2458  hypothetical protein  33.06 
 
 		 519 aa  84.3  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00115564  normal  0.62035 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4552  hypothetical protein  27.12 
 
 		 454 aa  73.6  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.420738 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10417  hypothetical protein  27.22 
 
 		 439 aa  67  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000130762  normal  0.910848 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37220  hypothetical protein  27.93 
 
 		 469 aa  62.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0532  hypothetical protein  28.57 
 
 		 439 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0554  hypothetical protein  27.68 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.656823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0542  hypothetical protein  27.68 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0482134  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4394  hypothetical protein  29.61 
 
 		 482 aa  61.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3507  hypothetical protein  33.53 
 
 		 419 aa  57  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2158  secreted protein  29.59 
 
 		 477 aa  50.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0200  hypothetical protein  24.24 
 
 		 439 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.749346  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3753  hypothetical protein  36.62 
 
 		 445 aa  46.6  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.18885  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0705  hypothetical protein  27.49 
 
 		 439 aa  43.9  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0579407 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>