65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_16010 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_16010  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  100 
 
 		 189 aa  382  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.963565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5179  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  30.05 
 
 		 195 aa  86.3  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1491  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  32.88 
 
 		 305 aa  67  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20840  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  35.59 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.715718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1207  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  34.48 
 
 		 302 aa  64.7  0.0000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.775185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13980  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.67 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0998449  normal  0.201528 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16160  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  37.72 
 
 		 326 aa  62.4  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0810308  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1694  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  30.83 
 
 		 122 aa  60.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0124693  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2429  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  31.74 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1923  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  30.25 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000334186 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2180  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  30.25 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0328454  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11940  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.19 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0263684  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11930  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.62 
 
 		 363 aa  57.8  0.00000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.188259  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10230  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.19 
 
 		 320 aa  57  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0570  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, FKBP-type  32.48 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0427302 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0338  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  29.41 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00440311  normal  0.11187 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16150  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.25 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0395566  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1773  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase 1  29.46 
 
 		 378 aa  55.1  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1537  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  29.2 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.104701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2179  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  30.77 
 
 		 309 aa  54.7  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0121928  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13970  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  33.06 
 
 		 401 aa  54.3  0.0000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.081322  normal  0.466348 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1060  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  31.4 
 
 		 133 aa  54.3  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1269  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  27.97 
 
 		 393 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4883  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  29.09 
 
 		 125 aa  53.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1922  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  31.37 
 
 		 322 aa  52.4  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000672335 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7175  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.5 
 
 		 124 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.100043 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2430  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  26.67 
 
 		 124 aa  51.6  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685002  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1117  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  29.09 
 
 		 124 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.223246 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3226  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  35.78 
 
 		 327 aa  50.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.172675  normal  0.0108474 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0929  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  30 
 
 		 134 aa  50.8  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.824794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1899  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  31.25 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.865415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5503  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  26.09 
 
 		 124 aa  49.3  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00337185  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4832  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  28.45 
 
 		 122 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4537  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  28.45 
 
 		 122 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.267804  normal  0.561602 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4450  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  28.45 
 
 		 122 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169235  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0769  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30 
 
 		 135 aa  48.5  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00146936  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2236  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  28.21 
 
 		 308 aa  48.5  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.2596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1682  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  31.36 
 
 		 358 aa  48.5  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000677619  normal  0.254933 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3970  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  32.56 
 
 		 222 aa  48.1  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.702234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5867  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase 1- like protein  27.97 
 
 		 319 aa  48.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56994  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4873  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  24.32 
 
 		 210 aa  47.8  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.746078  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0856  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  25.69 
 
 		 137 aa  47.4  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.407893  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1271  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  28.18 
 
 		 122 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1877  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  28.83 
 
 		 125 aa  47.4  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2285  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase 1  32.26 
 
 		 309 aa  46.6  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115227  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08130  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.17 
 
 		 134 aa  46.6  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.298894  normal  0.402814 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2314  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  27.97 
 
 		 308 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000175551  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02730  fk506-binding protein 39 kda, putative  26.26 
 
 		 405 aa  45.8  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2429  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  31.15 
 
 		 327 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.358773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2101  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  28.44 
 
 		 125 aa  45.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0147755  normal  0.282814 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1876  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  27.91 
 
 		 340 aa  45.8  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.492421 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5866  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase 1- like protein  25 
 
 		 301 aa  45.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4254  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  25 
 
 		 124 aa  45.8  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2963  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  27.03 
 
 		 135 aa  45.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00371076  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2669  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  31.11 
 
 		 136 aa  45.1  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.668384  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_23499  predicted protein  31.58 
 
 		 98 aa  45.1  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.961342 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4354  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  25 
 
 		 214 aa  43.9  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1740  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  25 
 
 		 120 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.580811 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2611  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  25.66 
 
 		 235 aa  43.9  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000370807  normal  0.149177 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5011  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  25 
 
 		 120 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0206135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3793  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  30.43 
 
 		 260 aa  43.5  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1998  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  29.13 
 
 		 292 aa  43.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.938702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0330  Peptidylprolyl isomerase  27.97 
 
 		 165 aa  42.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.494769 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1828  FKBP-type peptidylprolyl isomerase  25.37 
 
 		 322 aa  42.4  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1120  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.7 
 
 		 322 aa  41.2  0.008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>