37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_06670 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_06670  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  150  5.9999999999999996e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4673  hypothetical protein  63.16 
 
 		 82 aa  94  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.425775  normal  0.152791 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0826  hypothetical protein  60.27 
 
 		 75 aa  92.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.79823  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13233  hypothetical protein  61.33 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.367794 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1396  hypothetical protein  61.33 
 
 		 84 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.274716  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1450  hypothetical protein  61.33 
 
 		 84 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1414  hypothetical protein  61.33 
 
 		 84 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2133  hypothetical protein  60.27 
 
 		 76 aa  84.3  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000848597  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1794  hypothetical protein  62.32 
 
 		 83 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.471157  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1116  hypothetical protein  53.42 
 
 		 75 aa  81.3  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0123496  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4252  ATP-binding protein  52.56 
 
 		 78 aa  80.5  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118417  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0380  hypothetical protein  54.05 
 
 		 75 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.708075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0451  hypothetical protein  52.78 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.666499  decreased coverage  0.00000237564 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3807  hypothetical protein  52.78 
 
 		 75 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0736519  normal  0.464151 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3513  hypothetical protein  48.61 
 
 		 78 aa  74.7  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.573392  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1783  hypothetical protein  54.79 
 
 		 74 aa  73.6  0.0000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.254463  normal  0.771958 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4587  hypothetical protein  50 
 
 		 76 aa  73.2  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.095468 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0918  ATP-binding protein  55.56 
 
 		 75 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.779036  normal  0.530714 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1472  hypothetical protein  50 
 
 		 73 aa  72.4  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8391  hypothetical protein  45.21 
 
 		 76 aa  71.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1167  hypothetical protein  47.3 
 
 		 74 aa  69.3  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0683069  normal  0.438845 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0776  hypothetical protein  43.84 
 
 		 74 aa  68.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.71111  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2498  hypothetical protein  47.95 
 
 		 74 aa  67.8  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000444845 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2994  hypothetical protein  42.47 
 
 		 76 aa  65.1  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2776  hypothetical protein  46.58 
 
 		 74 aa  63.5  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0516732  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27680  hypothetical protein  43.06 
 
 		 74 aa  62.8  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.17849 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19220  hypothetical protein  41.67 
 
 		 75 aa  62.4  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0335861  normal  0.0253788 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1203  hypothetical protein  43.84 
 
 		 76 aa  62  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.354727  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11340  hypothetical protein  38.89 
 
 		 73 aa  60.1  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.931012  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7817  hypothetical protein  56.16 
 
 		 74 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2904  hypothetical protein  38.96 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.206099  normal  0.0236162 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0709  hypothetical protein  39.19 
 
 		 74 aa  53.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2476  hypothetical protein  39.73 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.2412  hitchhiker  0.00204483 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15260  hypothetical protein  39.73 
 
 		 74 aa  48.9  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0204554  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0108  hypothetical protein  31.94 
 
 		 74 aa  47.8  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0348  hypothetical protein  42.67 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.471785  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0443  hypothetical protein  31.51 
 
 		 72 aa  40.8  0.007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00010542 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>