37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2904 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2904  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  152  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.206099  normal  0.0236162 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27680  hypothetical protein  55.7 
 
 		 74 aa  85.1  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.17849 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0776  hypothetical protein  54.43 
 
 		 74 aa  82  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.71111  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1167  hypothetical protein  54.55 
 
 		 74 aa  81.6  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0683069  normal  0.438845 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1783  hypothetical protein  51.9 
 
 		 74 aa  77.4  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.254463  normal  0.771958 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19220  hypothetical protein  53.16 
 
 		 75 aa  75.5  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0335861  normal  0.0253788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0918  ATP-binding protein  47.44 
 
 		 75 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.779036  normal  0.530714 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2994  hypothetical protein  49.35 
 
 		 76 aa  71.6  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2498  hypothetical protein  51.9 
 
 		 74 aa  71.6  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000444845 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2776  hypothetical protein  46.84 
 
 		 74 aa  71.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0516732  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3807  hypothetical protein  45.57 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0736519  normal  0.464151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8391  hypothetical protein  48.05 
 
 		 76 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2476  hypothetical protein  56.96 
 
 		 75 aa  69.3  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.2412  hitchhiker  0.00204483 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0108  hypothetical protein  45.57 
 
 		 74 aa  68.2  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0451  hypothetical protein  47.37 
 
 		 75 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.666499  decreased coverage  0.00000237564 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4252  ATP-binding protein  44.74 
 
 		 78 aa  66.6  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118417  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1472  hypothetical protein  48.68 
 
 		 73 aa  66.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4587  hypothetical protein  46.05 
 
 		 76 aa  64.3  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.095468 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0709  hypothetical protein  41.56 
 
 		 74 aa  64.3  0.0000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1396  hypothetical protein  49.37 
 
 		 84 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.274716  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1414  hypothetical protein  49.37 
 
 		 84 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1450  hypothetical protein  49.37 
 
 		 84 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0380  hypothetical protein  44.74 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.708075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3513  hypothetical protein  42.31 
 
 		 78 aa  62  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.573392  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1203  hypothetical protein  41.77 
 
 		 76 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.354727  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1116  hypothetical protein  41.56 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0123496  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15260  hypothetical protein  43.42 
 
 		 74 aa  58.5  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0204554  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13233  hypothetical protein  42.86 
 
 		 90 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.367794 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2133  hypothetical protein  41.56 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000848597  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4673  hypothetical protein  45.45 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.425775  normal  0.152791 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11340  hypothetical protein  35.53 
 
 		 73 aa  56.2  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.931012  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06670  hypothetical protein  38.96 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7817  hypothetical protein  46.84 
 
 		 74 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0826  hypothetical protein  42.11 
 
 		 75 aa  54.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.79823  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1794  hypothetical protein  43.84 
 
 		 83 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.471157  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0443  hypothetical protein  32.91 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00010542 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0348  hypothetical protein  58.97 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.471785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>