21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0443 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0443  hypothetical protein  100 
 
 		 72 aa  146  1.0000000000000001e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00010542 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0108  hypothetical protein  40.54 
 
 		 74 aa  60.8  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27680  hypothetical protein  35.14 
 
 		 74 aa  51.6  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.17849 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1472  hypothetical protein  35.21 
 
 		 73 aa  51.2  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2498  hypothetical protein  40.28 
 
 		 74 aa  51.2  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000444845 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1783  hypothetical protein  32.43 
 
 		 74 aa  49.7  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.254463  normal  0.771958 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1167  hypothetical protein  34.72 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0683069  normal  0.438845 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0776  hypothetical protein  32 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.71111  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2776  hypothetical protein  36.49 
 
 		 74 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0516732  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3807  hypothetical protein  34.67 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0736519  normal  0.464151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8391  hypothetical protein  33.78 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2904  hypothetical protein  32.91 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.206099  normal  0.0236162 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19220  hypothetical protein  28 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0335861  normal  0.0253788 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2994  hypothetical protein  29.73 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0709  hypothetical protein  28.38 
 
 		 74 aa  43.9  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0918  ATP-binding protein  31.51 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.779036  normal  0.530714 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2476  hypothetical protein  32 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.2412  hitchhiker  0.00204483 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4673  hypothetical protein  31.51 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.425775  normal  0.152791 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1116  hypothetical protein  29.73 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0123496  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06670  hypothetical protein  31.51 
 
 		 76 aa  40.8  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0451  hypothetical protein  28.38 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.666499  decreased coverage  0.00000237564 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>