15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_02520 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_02520  Polyketide cyclase / dehydrase and lipid transport  100 
 
 		 151 aa  300  4.0000000000000003e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.101548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0865  Polyketide cyclase/dehydrase  56.76 
 
 		 151 aa  164  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0889  hypothetical protein  57.82 
 
 		 146 aa  164  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1078  hypothetical protein  61.19 
 
 		 147 aa  160  6e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.792268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4906  hypothetical protein  55.17 
 
 		 147 aa  156  8e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.730263  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4995  hypothetical protein  55.17 
 
 		 147 aa  156  8e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5274  hypothetical protein  54.48 
 
 		 147 aa  155  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.250946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1285  hypothetical protein  55.1 
 
 		 149 aa  155  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5530  hypothetical protein  54.42 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0430  Polyketide cyclase/dehydrase  57.04 
 
 		 146 aa  147  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.763548  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13750  hypothetical protein  51.7 
 
 		 147 aa  144  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.316158 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4012  Polyketide cyclase/dehydrase  53.74 
 
 		 148 aa  137  3.9999999999999997e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0219  hypothetical protein  46.62 
 
 		 148 aa  132  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.261485 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6670  hypothetical protein  45.21 
 
 		 149 aa  125  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  0.950066 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0954  hypothetical protein  34.31 
 
 		 156 aa  86.3  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000109947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>