15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6670 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6670  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  295  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  0.950066 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0219  hypothetical protein  62.86 
 
 
148 aa  175  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.261485 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1078  hypothetical protein  54.62 
 
 
147 aa  149  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.792268  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0865  Polyketide cyclase/dehydrase  45.95 
 
 
151 aa  133  8e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0889  hypothetical protein  44.83 
 
 
146 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02520  Polyketide cyclase / dehydrase and lipid transport  45.21 
 
 
151 aa  125  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.101548  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4906  hypothetical protein  45.77 
 
 
147 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.730263  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4995  hypothetical protein  45.77 
 
 
147 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5274  hypothetical protein  46.48 
 
 
147 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.250946  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13750  hypothetical protein  44.52 
 
 
147 aa  117  6e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.316158 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1285  hypothetical protein  44.37 
 
 
149 aa  117  7e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0430  Polyketide cyclase/dehydrase  45.21 
 
 
146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.763548  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5530  hypothetical protein  43.66 
 
 
154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4012  Polyketide cyclase/dehydrase  43.54 
 
 
148 aa  110  9e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0954  hypothetical protein  27.03 
 
 
156 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000109947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>