14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0219 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0219  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  298  1e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.261485 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6670  hypothetical protein  62.86 
 
 		 149 aa  175  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  0.950066 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0865  Polyketide cyclase/dehydrase  50 
 
 		 151 aa  136  8.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02520  Polyketide cyclase / dehydrase and lipid transport  46.62 
 
 		 151 aa  132  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.101548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1078  hypothetical protein  49.61 
 
 		 147 aa  131  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.792268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0889  hypothetical protein  45.27 
 
 		 146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5530  hypothetical protein  44.37 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1285  hypothetical protein  42.96 
 
 		 149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4906  hypothetical protein  44.37 
 
 		 147 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.730263  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4995  hypothetical protein  44.37 
 
 		 147 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5274  hypothetical protein  45.07 
 
 		 147 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.250946  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4012  Polyketide cyclase/dehydrase  44.76 
 
 		 148 aa  117  6e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13750  hypothetical protein  42.57 
 
 		 147 aa  114  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.316158 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0430  Polyketide cyclase/dehydrase  43.66 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.763548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>