36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_R0009 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_R0009  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00246508  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0041  tRNA-Arg  87.88 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000324571  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0026  tRNA-Arg  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000155557  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  86.3 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.581803  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2040  tRNA-Arg  86.3 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000158642  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1761  tRNA-Arg  86.3 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1468  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0001  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000193558  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0036  tRNA-Arg  91.11 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.269516  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0048  tRNA-Arg  84.93 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0020  tRNA-Arg  86.89 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0024  tRNA-Arg  92.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000092316  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0037  tRNA-Arg  85.94 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000022611  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0562  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0296  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0007006  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0024  tRNA-Arg  92.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000167821  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0003  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2137  tRNA-Arg  84.06 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00960478  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2212  tRNA-Arg  84.06 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.249062  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0011  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0015  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000291538  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0010  tRNA-Arg  84.38 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.552541  hitchhiker  0.000550393 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0054  tRNA-Arg  84.38 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.403688  hitchhiker  0.000271304 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0004  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t13672  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.126339  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0059  tRNA-Arg  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0014  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.951342 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0042  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00513283  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0037  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0828388  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0089  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0091  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000235506  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0030  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0160344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0525  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000996192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0003  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000103446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4199  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  6.81521e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0097  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000263693  normal  0.142126 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>