12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0558 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0558  hypothetical protein  100 
 
 		 61 aa  124  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0079  phage transcriptional regulator AlpA  69.49 
 
 		 63 aa  85.9  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.04332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8661  hypothetical protein  66.1 
 
 		 63 aa  81.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0149  hypothetical protein  57.63 
 
 		 64 aa  78.2  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0692  hypothetical protein  50.85 
 
 		 64 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.128598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7404  hypothetical protein  58 
 
 		 68 aa  61.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3944  putative DNA-binding protein  52.54 
 
 		 62 aa  60.8  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0566  hypothetical protein  48.28 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6842  phage transcriptional regulator, AlpA  45.28 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.19362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0350  hypothetical protein  50.94 
 
 		 67 aa  55.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0600822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0975  hypothetical protein  47.27 
 
 		 62 aa  51.6  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4453  hypothetical protein  46.43 
 
 		 80 aa  49.7  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>