12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7404 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7404  hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  135  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0692  hypothetical protein  82 
 
 		 64 aa  88.6  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.128598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0149  hypothetical protein  78 
 
 		 64 aa  86.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8661  hypothetical protein  72 
 
 		 63 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0079  phage transcriptional regulator AlpA  66 
 
 		 63 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.04332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0558  hypothetical protein  58 
 
 		 61 aa  61.2  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3944  putative DNA-binding protein  53.33 
 
 		 62 aa  53.9  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6842  phage transcriptional regulator, AlpA  53.49 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.19362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0975  hypothetical protein  51.16 
 
 		 62 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0566  hypothetical protein  40 
 
 		 75 aa  45.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4453  hypothetical protein  43.18 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0350  hypothetical protein  50 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0600822  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>