12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0149 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0149  hypothetical protein  100 
 
 		 64 aa  132  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0692  hypothetical protein  79.69 
 
 		 64 aa  106  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.128598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8661  hypothetical protein  75 
 
 		 63 aa  103  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0079  phage transcriptional regulator AlpA  72.88 
 
 		 63 aa  96.7  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.04332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7404  hypothetical protein  78 
 
 		 68 aa  86.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0558  hypothetical protein  57.63 
 
 		 61 aa  78.2  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3944  putative DNA-binding protein  55 
 
 		 62 aa  68.2  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6842  phage transcriptional regulator, AlpA  47.54 
 
 		 75 aa  64.3  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.19362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0350  hypothetical protein  48.33 
 
 		 67 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0600822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0566  hypothetical protein  44.26 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0975  hypothetical protein  43.33 
 
 		 62 aa  54.3  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4453  hypothetical protein  46.43 
 
 		 80 aa  51.2  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>