12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0079 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0079  phage transcriptional regulator AlpA  100 
 
 		 63 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.04332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8661  hypothetical protein  74.6 
 
 		 63 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0149  hypothetical protein  72.88 
 
 		 64 aa  96.7  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0558  hypothetical protein  69.49 
 
 		 61 aa  85.9  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0692  hypothetical protein  62.5 
 
 		 64 aa  84.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.128598 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3944  putative DNA-binding protein  66.13 
 
 		 62 aa  74.7  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7404  hypothetical protein  66 
 
 		 68 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6842  phage transcriptional regulator, AlpA  53.45 
 
 		 75 aa  64.3  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.19362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0566  hypothetical protein  48.33 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0350  hypothetical protein  57.69 
 
 		 67 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0600822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0975  hypothetical protein  52.63 
 
 		 62 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4453  hypothetical protein  50 
 
 		 80 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>