More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0078 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0238  aldehyde dehydrogenase  95.36 
 
 
474 aa  891    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.851453  decreased coverage  0.000681524 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0078  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
474 aa  951    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1965  Aldehyde Dehydrogenase  53.56 
 
 
468 aa  457  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14840  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  50.98 
 
 
481 aa  441  9.999999999999999e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0170872  normal  0.129561 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02560  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  50.32 
 
 
481 aa  437  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.799262  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1930  Aldehyde Dehydrogenase  54.17 
 
 
480 aa  427  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.68692 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3615  aldehyde dehydrogenase  44.84 
 
 
460 aa  418  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.30982  normal  0.838762 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2364  aldehyde dehydrogenase  53.9 
 
 
475 aa  411  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0648683  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00587  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  43.6 
 
 
468 aa  403  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0165  Aldehyde Dehydrogenase  45.1 
 
 
459 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0486514 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2358  aldehyde Dehydrogenase  42.21 
 
 
461 aa  396  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.435547  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01050  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  47.87 
 
 
504 aa  387  1e-106  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.958772  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2489  Aldehyde Dehydrogenase  44.14 
 
 
463 aa  384  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2512  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  39.7 
 
 
457 aa  380  1e-104  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00297812  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0099  aldehyde dehydrogenase  45.38 
 
 
470 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2010  aldehyde dehydrogenase  42.54 
 
 
459 aa  379  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1977  aldehyde dehydrogenase  42.54 
 
 
459 aa  379  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.205682  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0090  aldehyde dehydrogenase  45.38 
 
 
470 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2296  aldehyde dehydrogenase  41.02 
 
 
458 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.69034  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1456  aldehyde dehydrogenase  41.5 
 
 
459 aa  375  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.133276  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0080  aldehyde dehydrogenase  44.87 
 
 
470 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.255507 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2610  aldehyde dehydrogenase  41.59 
 
 
458 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.514086  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2652  aldehyde dehydrogenase  42.33 
 
 
459 aa  373  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.309423 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0497  putative aldehyde dehydrogenase  45.79 
 
 
459 aa  370  1e-101  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0365666 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3041  aldehyde dehydrogenase  41.36 
 
 
461 aa  370  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0489  aldehyde dehydrogenase  46.44 
 
 
459 aa  372  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0498787 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2181  Aldehyde Dehydrogenase  42.03 
 
 
456 aa  367  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1838  putative aldehyde dehydrogenase  45.8 
 
 
459 aa  363  3e-99  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0334  Aldehyde Dehydrogenase  44.49 
 
 
465 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03681  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  42.29 
 
 
449 aa  363  4e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.975414  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0449  Aldehyde Dehydrogenase  42.86 
 
 
456 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0742  aldehyde dehydrogenase  42.86 
 
 
468 aa  363  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0105  aldehyde dehydrogenase  43.25 
 
 
470 aa  362  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1397  aldehyde dehydrogenase  44.83 
 
 
455 aa  362  8e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.192209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1176  aldehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  44.6 
 
 
455 aa  362  8e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1200  aldehyde dehydrogenase  44.39 
 
 
455 aa  362  8e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.625274  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1198  aldehyde dehydrogenase  44.72 
 
 
455 aa  361  2e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.869515  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1374  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  44.72 
 
 
455 aa  361  2e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000209358 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1296  aldehyde dehydrogenase  44.72 
 
 
455 aa  361  2e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2158  aldehyde dehydrogenase  43.41 
 
 
462 aa  361  2e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.734921  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1438  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  44.6 
 
 
455 aa  359  6e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00047952  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21711  putative aldehyde dehydrogenase  44.37 
 
 
459 aa  358  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0450332 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1178  aldehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  44.37 
 
 
455 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.198851  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1336  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  43.84 
 
 
455 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2121  Aldehyde Dehydrogenase  42.86 
 
 
469 aa  356  5e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.604526  decreased coverage  0.00230582 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1918  Aldehyde Dehydrogenase  43.44 
 
 
475 aa  356  5.999999999999999e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04241  putative aldehyde dehydrogenase  42.38 
 
 
459 aa  353  2.9999999999999997e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.844488 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4713  aldehyde dehydrogenase  41.47 
 
 
442 aa  353  4e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1709  putative aldehyde dehydrogenase  42.16 
 
 
459 aa  353  5e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0791372  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2085  Aldehyde Dehydrogenase_  46.05 
 
 
454 aa  352  5.9999999999999994e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.746204  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4008  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  43.45 
 
 
455 aa  351  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.148119  hitchhiker  0.00000000000192548 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08936  aldehyde dehydrogenase  41.55 
 
 
457 aa  348  1e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.539716  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1006  aldehyde dehydrogenase  44.16 
 
 
454 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0438  aldehyde dehydrogenase  42.83 
 
 
484 aa  342  8e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0433999  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5442  aldehyde dehydrogenase  43.9 
 
 
486 aa  340  2.9999999999999998e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274338  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0300  aldehyde dehydrogenase  44.22 
 
 
458 aa  340  5e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0223565  hitchhiker  0.0000134902 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2238  aldehyde dehydrogenase  40.44 
 
 
472 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0607  aldehyde dehydrogenase  42.64 
 
 
484 aa  335  7.999999999999999e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0549994  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4268  Aldehyde Dehydrogenase  39.82 
 
 
462 aa  334  2e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0440  aldehyde dehydrogenase  44.55 
 
 
483 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461443  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1742  Aldehyde Dehydrogenase  40.27 
 
 
476 aa  330  3e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1754  aldehyde dehydrogenase  44.13 
 
 
480 aa  330  3e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0117  aldehyde dehydrogenase  41.99 
 
 
476 aa  326  5e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0821  Aldehyde Dehydrogenase  43.05 
 
 
475 aa  326  6e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0672695  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10148  aldehyde dehydrogenase  41.6 
 
 
506 aa  323  4e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1254  aldehyde dehydrogenase  42.98 
 
 
471 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38059  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2479  Aldehyde Dehydrogenase  39.38 
 
 
469 aa  317  3e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.410895  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3846  aldehyde dehydrogenase  40.97 
 
 
477 aa  316  6e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3572  aldehyde dehydrogenase  37.82 
 
 
481 aa  314  1.9999999999999998e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.072637  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1503  aldehyde dehydrogenase  42.32 
 
 
477 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3068  aldehyde dehydrogenase  40.86 
 
 
480 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.919224 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6421  aldehyde dehydrogenase  40.65 
 
 
480 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3357  aldehyde dehydrogenase  36.63 
 
 
475 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3090  aldehyde dehydrogenase  40.86 
 
 
480 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2458  aldehyde dehydrogenase  40.86 
 
 
480 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0388363  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3072  aldehyde dehydrogenase  40.86 
 
 
480 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0337  putative aldehyde dehydrogenase  33.97 
 
 
463 aa  311  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.704736  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03581  putative aldehyde dehydrogenase  35.7 
 
 
463 aa  310  4e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.995721  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03571  putative aldehyde dehydrogenase  34.49 
 
 
463 aa  310  5e-83  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1351  Aldehyde Dehydrogenase  40.98 
 
 
472 aa  309  5.9999999999999995e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0872  aldehyde dehydrogenase  37.92 
 
 
474 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3103  aldehyde dehydrogenase  38.48 
 
 
474 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.471073 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0988  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  38.68 
 
 
475 aa  306  4.0000000000000004e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.828062  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1214  putative NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  42.73 
 
 
477 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.173506  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3118  aldehyde dehydrogenase  40.22 
 
 
480 aa  306  6e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3150  aldehyde dehydrogenase  37.47 
 
 
474 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2982  aldehyde dehydrogenase  39.78 
 
 
480 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0980355 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0460  putative aldehyde dehydrogenase  42.31 
 
 
476 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5345  aldehyde dehydrogenase  40.75 
 
 
476 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04810  putative aldehyde dehydrogenase  41.74 
 
 
476 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4187  aldehyde dehydrogenase  39.48 
 
 
476 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2151  coniferyl aldehyde dehydrogenase  40.65 
 
 
472 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2938  coniferyl aldehyde dehydrogenase  40.65 
 
 
472 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3273  coniferyl aldehyde dehydrogenase  40.65 
 
 
472 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0409  coniferyl aldehyde dehydrogenase  40.65 
 
 
472 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0214  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  40.65 
 
 
472 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3409  coniferyl aldehyde dehydrogenase  40.65 
 
 
472 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1028  Aldehyde Dehydrogenase  37.5 
 
 
474 aa  302  8.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.889075 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3683  coniferyl aldehyde dehydrogenase  35.98 
 
 
474 aa  302  9e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0782  aldehyde dehydrogenase  37.45 
 
 
484 aa  302  9e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.790584  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>