34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2590 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0373    94.02 
 
 
4490 bp  1463    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.221643  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2654    96.75 
 
 
3355 bp  1388    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00355467  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2630    97.85 
 
 
1168 bp  2101    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2591  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1128 bp  2236    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2590    100 
 
 
1949 bp  3864    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2545    97.77 
 
 
1166 bp  2099    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2513  transposase IS4 family protein  96.96 
 
 
1053 bp  1832    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2503    98.15 
 
 
1138 bp  795    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2486  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  97.94 
 
 
1068 bp  787    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.0095339  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2484    97.39 
 
 
795 bp  1360    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.015461  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2473    97.3 
 
 
711 bp  1245    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.194018  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2381    97.48 
 
 
985 bp  779    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2259    97.03 
 
 
1069 bp  763    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2208  transposase IS4 family protein  96.68 
 
 
1053 bp  1810    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2118  transposase IS4 family protein  96.68 
 
 
1053 bp  1810    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2117    96.7 
 
 
2161 bp  2347    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.972083  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2043  transposase IS4 family protein  97.71 
 
 
1092 bp  1966    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.547441  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1497  transposase IS4 family protein  97.53 
 
 
1092 bp  1951    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1474  transposase IS4 family protein  97.71 
 
 
1092 bp  1966    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1473    97.73 
 
 
2026 bp  2458    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1109    97.26 
 
 
2384 bp  1675    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1108    97.28 
 
 
3435 bp  1754    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0874    97.67 
 
 
1248 bp  1925    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0265  transposase IS4 family protein  97.91 
 
 
1053 bp  1913    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0374    94.3 
 
 
3551 bp  1423    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0480919  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0534    98.63 
 
 
1069 bp  819    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2045    90.62 
 
 
973 bp  531  1e-148  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0267006  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0722    96.27 
 
 
1557 bp  452  1.0000000000000001e-124  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172226  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2731  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  89.57 
 
 
1074 bp  125  4.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0404628  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2749  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  85.48 
 
 
1074 bp  103  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0696555  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0806  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  91.94 
 
 
1068 bp  83.8  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.268698  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0712    97.22 
 
 
2100 bp  63.9  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0721  Transposase, ISC1217  100 
 
 
411 bp  63.9  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.864923  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2322  transposase, IS605 OrfB family  100 
 
 
1251 bp  54  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.112043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>