23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2117 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2043  transposase IS4 family protein  97.44 
 
 
1092 bp  1943    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.547441  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2654    95.88 
 
 
3355 bp  1332    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00355467  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2630    96.92 
 
 
1168 bp  2022    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2591  transposase IS4 family protein  96.53 
 
 
1128 bp  1919    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2590    96.7 
 
 
1949 bp  2347    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2545    96.99 
 
 
1166 bp  2020    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2513  transposase IS4 family protein  97.62 
 
 
1053 bp  1887    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2484    96.48 
 
 
795 bp  1304    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.015461  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2473    97.71 
 
 
711 bp  1261    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.194018  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2208  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1053 bp  2087    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2118  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1053 bp  2087    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2117    100 
 
 
2161 bp  4284    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.972083  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0265  transposase IS4 family protein  96.68 
 
 
1053 bp  1810    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1497  transposase IS4 family protein  97.07 
 
 
1092 bp  1911    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1474  transposase IS4 family protein  97.44 
 
 
1092 bp  1943    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1473    97.51 
 
 
2026 bp  2440    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1109    97.46 
 
 
2384 bp  1683    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1108    97.48 
 
 
3435 bp  1770    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0874    97 
 
 
1248 bp  1861    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0374    96 
 
 
3551 bp  1542    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0480919  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0373    95.67 
 
 
4490 bp  1590    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.221643  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0722    96.21 
 
 
1557 bp  444  9.999999999999999e-123  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172226  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0721  Transposase, ISC1217  100 
 
 
411 bp  63.9  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.864923  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>