23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1473 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2043  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1092 bp  2165    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.547441  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2654    96.62 
 
 
3355 bp  1380    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00355467  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2630    97.77 
 
 
1168 bp  2093    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2591  transposase IS4 family protein  97.51 
 
 
1128 bp  2008    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2590    97.73 
 
 
1949 bp  2458    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2545    97.86 
 
 
1166 bp  2107    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2513  transposase IS4 family protein  98.48 
 
 
1053 bp  1955    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2484    97.39 
 
 
795 bp  1360    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.015461  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2473    98.01 
 
 
711 bp  1285    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.194018  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2208  transposase IS4 family protein  97.43 
 
 
1053 bp  1867    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2118  transposase IS4 family protein  97.43 
 
 
1053 bp  1867    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2117    97.51 
 
 
2161 bp  2440    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.972083  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0265  transposase IS4 family protein  97.9 
 
 
1053 bp  1907    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1497  transposase IS4 family protein  99.45 
 
 
1092 bp  2117    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1474  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1092 bp  2165    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1473    100 
 
 
2026 bp  4016    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1109    98.63 
 
 
2384 bp  1778    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1108    98.69 
 
 
3435 bp  1871    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0874    98.41 
 
 
1248 bp  1988    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0374    95.8 
 
 
3551 bp  1530    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0480919  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0373    95.56 
 
 
4490 bp  1578    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.221643  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0722    97.39 
 
 
1557 bp  476  1.0000000000000001e-131  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172226  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0721  Transposase, ISC1217  100 
 
 
411 bp  67.9  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.864923  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>