17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0712 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1118  transposase IS4 family protein  95.14 
 
 
900 bp  846    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2684  transposase IS4 family protein  95.14 
 
 
900 bp  846    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2578  transposase IS4 family protein  95.14 
 
 
900 bp  846    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2556    94.32 
 
 
876 bp  811    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2514  transposase IS4 family protein  93.83 
 
 
894 bp  783    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2343  transposase IS4 family protein  97.68 
 
 
804 bp  771    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2169    96.05 
 
 
896 bp  880    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0144    95.24 
 
 
904 bp  819    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.937566  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1109    96.97 
 
 
2384 bp  2129    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1108    96.97 
 
 
3435 bp  2129    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0948  transposase IS4 family protein  95.14 
 
 
900 bp  846    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0712    100 
 
 
2100 bp  4163    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0386    97.16 
 
 
880 bp  926    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.254887  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0351    97.42 
 
 
294 bp  474  1.0000000000000001e-131  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.658304  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2322  transposase, IS605 OrfB family  97.44 
 
 
1251 bp  139  3.9999999999999996e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.112043  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0748    87.5 
 
 
96 bp  63.9  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.302666  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2590    97.22 
 
 
1949 bp  63.9  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>