14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2556 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0144    95.68 
 
 
904 bp  1421    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.937566  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0386    95.72 
 
 
880 bp  1459    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.254887  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0712    94.32 
 
 
2100 bp  811    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0948  transposase IS4 family protein  96.56 
 
 
900 bp  1536    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1118  transposase IS4 family protein  96.56 
 
 
900 bp  1536    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2169    97.1 
 
 
896 bp  1570    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2343  transposase IS4 family protein  96.39 
 
 
804 bp  1368    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2514  transposase IS4 family protein  95.65 
 
 
894 bp  1467    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2556    100 
 
 
876 bp  1737    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2578  transposase IS4 family protein  96.56 
 
 
900 bp  1536    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2684  transposase IS4 family protein  96.56 
 
 
900 bp  1536    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0351    97.42 
 
 
294 bp  482  1e-134  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.658304  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0748    83.16 
 
 
96 bp  61.9  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.302666  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0065    87.72 
 
 
95 bp  58  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>