26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3969 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3969  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  803    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4131  hypothetical protein  74.86 
 
 		 388 aa  598  1e-170  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0130576 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0603  hypothetical protein  67.99 
 
 		 386 aa  558  1e-158  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3221  hypothetical protein  70.94 
 
 		 386 aa  556  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0332861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0546  hypothetical protein  61.03 
 
 		 394 aa  524  1e-147  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0835  hypothetical protein  65 
 
 		 385 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0812  hypothetical protein  62.78 
 
 		 389 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000162038  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0844  hypothetical protein  63.33 
 
 		 389 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.969791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3441  hypothetical protein  64.17 
 
 		 385 aa  496  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00415893  normal  0.25947 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3329  hypothetical protein  64.17 
 
 		 385 aa  496  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.525149  normal  0.888641 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3158  hypothetical protein  63.89 
 
 		 384 aa  495  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0013201  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0837  hypothetical protein  63.06 
 
 		 389 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.240462  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0693  hypothetical protein  64.17 
 
 		 385 aa  495  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000226756  normal  0.897132 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0578  hypothetical protein  62.19 
 
 		 385 aa  489  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.056117  normal  0.0560142 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3523  hypothetical protein  62.01 
 
 		 384 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0015438  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2971  hypothetical protein  58.46 
 
 		 399 aa  484  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0733  hypothetical protein  45.62 
 
 		 391 aa  332  6e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1934  hypothetical protein  32.74 
 
 		 364 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.367322 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4467  secreted protein  32.99 
 
 		 423 aa  162  8.000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.207667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2682  hypothetical protein  30 
 
 		 453 aa  153  5.9999999999999996e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2117  secreted protein  31.28 
 
 		 415 aa  150  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.512527  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2869  hypothetical protein  28.15 
 
 		 537 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00620  hypothetical protein  27.4 
 
 		 553 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.486509  normal  0.628936 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0052  hypothetical protein  29.87 
 
 		 553 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.28742  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6996  hypothetical protein  34.51 
 
 		 500 aa  90.1  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17670  hypothetical protein  33.04 
 
 		 279 aa  53.5  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.276623  normal  0.654681 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>