16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2403 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2403  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  253  5e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.914674  normal  0.255888 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2200  hypothetical protein  90.98 
 
 		 122 aa  237  4e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0235692  hitchhiker  0.00000305 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1855  hypothetical protein  66.12 
 
 		 121 aa  167  6e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.163669  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1350  hypothetical protein  57.02 
 
 		 131 aa  151  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2835  hypothetical protein  59.02 
 
 		 122 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131961  normal  0.525857 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2752  hypothetical protein  57.85 
 
 		 122 aa  149  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2410  hypothetical protein  53.28 
 
 		 131 aa  148  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0240851 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2644  hypothetical protein  61.26 
 
 		 115 aa  147  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2577  hypothetical protein  60.36 
 
 		 115 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1418  hypothetical protein  59.13 
 
 		 115 aa  143  9e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1547  hypothetical protein  57.39 
 
 		 115 aa  140  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1520  hypothetical protein  57.39 
 
 		 115 aa  139  9e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1511  hypothetical protein  57.39 
 
 		 115 aa  139  9e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1702  hypothetical protein  52.46 
 
 		 122 aa  138  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0705  hypothetical protein  51.3 
 
 		 119 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00561381  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6046  hypothetical protein  30.43 
 
 		 313 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>