16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0705 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_0705  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  251  3e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00561381  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1350  hypothetical protein  61.74 
 
 
131 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1418  hypothetical protein  60.53 
 
 
115 aa  157  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2752  hypothetical protein  56.52 
 
 
122 aa  157  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2577  hypothetical protein  57.02 
 
 
115 aa  157  6e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2644  hypothetical protein  57.02 
 
 
115 aa  156  7e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1520  hypothetical protein  59.65 
 
 
115 aa  156  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1511  hypothetical protein  59.65 
 
 
115 aa  156  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2835  hypothetical protein  59.13 
 
 
122 aa  156  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131961  normal  0.525857 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1702  hypothetical protein  57.39 
 
 
122 aa  154  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1547  hypothetical protein  58.77 
 
 
115 aa  154  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2410  hypothetical protein  48.7 
 
 
131 aa  133  9e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0240851 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2403  hypothetical protein  51.3 
 
 
122 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.914674  normal  0.255888 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2200  hypothetical protein  48.7 
 
 
122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0235692  hitchhiker  0.00000305 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1855  hypothetical protein  46.96 
 
 
121 aa  124  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.163669  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6046  hypothetical protein  37.33 
 
 
313 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>