16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1702 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1702  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  256  6e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2752  hypothetical protein  85.95 
 
 		 122 aa  225  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2577  hypothetical protein  86.09 
 
 		 115 aa  216  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2644  hypothetical protein  85.22 
 
 		 115 aa  214  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2835  hypothetical protein  76.23 
 
 		 122 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131961  normal  0.525857 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1520  hypothetical protein  76.52 
 
 		 115 aa  202  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1511  hypothetical protein  76.52 
 
 		 115 aa  202  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1547  hypothetical protein  76.52 
 
 		 115 aa  200  5e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1418  hypothetical protein  78.26 
 
 		 115 aa  200  7e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1350  hypothetical protein  61.98 
 
 		 131 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0705  hypothetical protein  57.39 
 
 		 119 aa  154  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00561381  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1855  hypothetical protein  55.37 
 
 		 121 aa  149  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.163669  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2410  hypothetical protein  50 
 
 		 131 aa  146  9e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0240851 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2403  hypothetical protein  52.46 
 
 		 122 aa  138  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.914674  normal  0.255888 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2200  hypothetical protein  50.82 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0235692  hitchhiker  0.00000305 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6046  hypothetical protein  28.16 
 
 		 313 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>