23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6236 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6236  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  100 
 
 		 110 aa  219  9e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.289172 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1153  putative growth inhibitor  57.69 
 
 		 104 aa  119  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.245557  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1750  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  41.12 
 
 		 111 aa  83.6  8e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0732  CopG family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000257489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7690  hypothetical protein  39.29 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2124  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  43.59 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0033  PemK-like protein  40.74 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0352  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.8 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1901  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.53 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00690873  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2503  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.04 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0118079  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2247  PemK family protein  26.37 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.191111  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3378  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.04 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1099  ChpA protein  37.11 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0963556  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1640  toxin-antitoxin addiction module toxin component MazF (an endoRNAse)  29.91 
 
 		 118 aa  43.9  0.0008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0998854  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2436  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.33 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2470  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  25.27 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0024  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.52 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2437  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.59 
 
 		 107 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2605  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.68 
 
 		 109 aa  41.2  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3432  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.67 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.328509  normal  0.0986406 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0041  mRNA endonuclease-like protein PemK  32.47 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2143  PemK family protein  31.53 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2105  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.53 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>