40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2617 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2617  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  236  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1446  hypothetical protein  81.36 
 
 
118 aa  193  6e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000347813  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2439  hypothetical protein  78.81 
 
 
118 aa  190  5e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000289339  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3047  hypothetical protein  77.97 
 
 
118 aa  189  8e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.224586  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1602  hypothetical protein  78.81 
 
 
118 aa  189  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2691  hypothetical protein  76.27 
 
 
118 aa  188  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000843303 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1689  hypothetical protein  76.27 
 
 
118 aa  188  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0166047  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1652  hypothetical protein  76.27 
 
 
118 aa  188  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.52995  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1667  hypothetical protein  76.27 
 
 
118 aa  188  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1542  hypothetical protein  74.58 
 
 
118 aa  183  6e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2601  hypothetical protein  75.42 
 
 
118 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000829819 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2509  hypothetical protein  74.58 
 
 
118 aa  181  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00577803 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2439  hypothetical protein  74.58 
 
 
118 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.524862  hitchhiker  0.000641734 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2832  hypothetical protein  74.58 
 
 
118 aa  178  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2447  hypothetical protein  70.34 
 
 
118 aa  177  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2073  unclonable  0.00000187766 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0121  hypothetical protein  55.08 
 
 
145 aa  134  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0013  hypothetical protein  53.39 
 
 
118 aa  133  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06768  hypothetical protein  47.46 
 
 
118 aa  123  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000856  hypothetical protein  46.61 
 
 
118 aa  121  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4444  hypothetical protein  47.83 
 
 
120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4162  hypothetical protein  48.31 
 
 
120 aa  106  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4103  hypothetical protein  46.28 
 
 
120 aa  102  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03458  hypothetical protein  46.28 
 
 
120 aa  102  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03409  hypothetical protein  46.28 
 
 
120 aa  102  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0103  conserved hypothetical protein  46.28 
 
 
120 aa  102  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4973  hypothetical protein  46.28 
 
 
120 aa  102  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4020  hypothetical protein  46.28 
 
 
120 aa  102  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3936  hypothetical protein  46.28 
 
 
120 aa  102  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0109  hypothetical protein  46.28 
 
 
120 aa  102  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3810  hypothetical protein  46.28 
 
 
120 aa  102  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.38625  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0077  hypothetical protein  46.96 
 
 
137 aa  101  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4125  hypothetical protein  45.13 
 
 
118 aa  99.4  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3967  hypothetical protein  48.31 
 
 
120 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.770854 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4012  hypothetical protein  48.31 
 
 
120 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.419333 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3889  hypothetical protein  48.31 
 
 
120 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3905  hypothetical protein  48.31 
 
 
120 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4074  hypothetical protein  48.31 
 
 
120 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0030  hypothetical protein  45.13 
 
 
118 aa  99.4  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3777  hypothetical protein  45.13 
 
 
118 aa  99.4  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0133  hypothetical protein  42.37 
 
 
120 aa  89.4  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>