40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_4162 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_4162  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  239  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4444  hypothetical protein  92.5 
 
 		 120 aa  221  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0030  hypothetical protein  69.23 
 
 		 118 aa  162  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3777  hypothetical protein  69.23 
 
 		 118 aa  162  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4125  hypothetical protein  69.23 
 
 		 118 aa  162  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0077  hypothetical protein  66.67 
 
 		 137 aa  157  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4103  hypothetical protein  65.83 
 
 		 120 aa  144  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4973  hypothetical protein  65.83 
 
 		 120 aa  144  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4020  hypothetical protein  65.83 
 
 		 120 aa  144  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3936  hypothetical protein  65.83 
 
 		 120 aa  144  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0103  conserved hypothetical protein  65.83 
 
 		 120 aa  144  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4074  hypothetical protein  66.67 
 
 		 120 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3905  hypothetical protein  66.67 
 
 		 120 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3889  hypothetical protein  66.67 
 
 		 120 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03409  hypothetical protein  65.83 
 
 		 120 aa  144  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3810  hypothetical protein  65.83 
 
 		 120 aa  144  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.38625  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4012  hypothetical protein  66.67 
 
 		 120 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.419333 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3967  hypothetical protein  66.67 
 
 		 120 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.770854 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03458  hypothetical protein  65.83 
 
 		 120 aa  144  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0109  hypothetical protein  65.83 
 
 		 120 aa  144  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0133  hypothetical protein  63.33 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2832  hypothetical protein  53.04 
 
 		 118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2509  hypothetical protein  52.17 
 
 		 118 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00577803 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1542  hypothetical protein  53.04 
 
 		 118 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2439  hypothetical protein  52.17 
 
 		 118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.524862  hitchhiker  0.000641734 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2601  hypothetical protein  52.17 
 
 		 118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000829819 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2447  hypothetical protein  48.7 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2073  unclonable  0.00000187766 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1446  hypothetical protein  49.15 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000347813  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1689  hypothetical protein  49.57 
 
 		 118 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0166047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2691  hypothetical protein  49.57 
 
 		 118 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000843303 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1667  hypothetical protein  49.57 
 
 		 118 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1652  hypothetical protein  49.57 
 
 		 118 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.52995  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1602  hypothetical protein  49.57 
 
 		 118 aa  107  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2617  hypothetical protein  48.31 
 
 		 118 aa  106  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000856  hypothetical protein  46.09 
 
 		 118 aa  105  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3047  hypothetical protein  47.46 
 
 		 118 aa  103  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.224586  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2439  hypothetical protein  46.96 
 
 		 118 aa  103  9e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000289339  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06768  hypothetical protein  45.22 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0121  hypothetical protein  40 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0013  hypothetical protein  41.74 
 
 		 118 aa  93.2  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>