51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1920 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_1920  deoxycytidine triphosphate deaminase  100 
 
 
73 aa  148  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2455  deoxycytidine triphosphate deaminase  70.83 
 
 
193 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000233187  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2462  deoxycytidine triphosphate deaminase  70.83 
 
 
193 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000265475  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2575  deoxycytidine triphosphate deaminase  70.83 
 
 
193 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.109993  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1889  deoxycytidine triphosphate deaminase  70.83 
 
 
193 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000932331  normal  0.0428491 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2243  deoxycytidine triphosphate deaminase  69.44 
 
 
194 aa  99.4  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1763  deoxycytidine triphosphate deaminase  68.06 
 
 
193 aa  98.2  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0121906  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1658  deoxycytidine triphosphate deaminase  68.06 
 
 
193 aa  98.2  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1733  deoxycytidine triphosphate deaminase  68.06 
 
 
193 aa  97.4  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00151185  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2217  deoxycytidine triphosphate deaminase  68.06 
 
 
193 aa  97.1  8e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2616  deoxycytidine triphosphate deaminase  68.06 
 
 
193 aa  96.7  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2046  deoxycytidine triphosphate deaminase  62.5 
 
 
194 aa  93.6  9e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.416857  normal  0.66664 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1576  deoxycytidine triphosphate deaminase  59.72 
 
 
194 aa  89.4  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0756  deoxycytidine triphosphate deaminase  60.71 
 
 
194 aa  77.8  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1290  deoxycytidine triphosphate deaminase  54.29 
 
 
193 aa  76.6  0.00000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2837  deoxycytidine triphosphate deaminase  62.96 
 
 
198 aa  76.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.114909  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0645  deoxycytidine triphosphate deaminase  51.43 
 
 
194 aa  74.3  0.0000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000193078  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1198  deoxycytidine triphosphate deaminase  52.86 
 
 
194 aa  74.3  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2870  deoxycytidine triphosphate deaminase  52.86 
 
 
193 aa  73.9  0.0000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2551  deoxycytidine triphosphate deaminase  54.29 
 
 
193 aa  73.6  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2452  deoxycytidine triphosphate deaminase  54.29 
 
 
193 aa  73.6  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3194  deoxycytidine triphosphate deaminase  54.29 
 
 
193 aa  73.6  0.0000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.075679  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3041  deoxycytidine triphosphate deaminase  52.86 
 
 
193 aa  73.2  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1548  deoxycytidine triphosphate deaminase  50.72 
 
 
194 aa  70.5  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.140824  hitchhiker  0.0000237389 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1577  deoxycytidine triphosphate deaminase  50 
 
 
193 aa  68.2  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.600323 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2679  deoxycytidine triphosphate deaminase  51.43 
 
 
193 aa  68.2  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.386804 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1167  deoxycytidine triphosphate deaminase  48.57 
 
 
193 aa  67  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0995  deoxycytidine triphosphate deaminase  48.57 
 
 
193 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3002  deoxycytidine triphosphate deaminase  48.57 
 
 
193 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.304986 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01971  deoxycytidine triphosphate deaminase  48.57 
 
 
193 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1576  deoxycytidine triphosphate deaminase  48.57 
 
 
193 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0207853  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2358  deoxycytidine triphosphate deaminase  48.57 
 
 
193 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2205  deoxycytidine triphosphate deaminase  48.57 
 
 
193 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01960  hypothetical protein  48.57 
 
 
193 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1592  deoxycytidine triphosphate deaminase  48.57 
 
 
193 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00335404  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2462  deoxycytidine triphosphate deaminase  48.57 
 
 
193 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.417752 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2248  deoxycytidine triphosphate deaminase  48.57 
 
 
193 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2355  deoxycytidine triphosphate deaminase  48.57 
 
 
193 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.506622  normal  0.430961 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2348  deoxycytidine triphosphate deaminase  48.57 
 
 
193 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2304  deoxycytidine triphosphate deaminase  48.57 
 
 
193 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01987  deoxycytidine triphosphate deaminase  51.79 
 
 
197 aa  65.1  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.303345  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1043  deoxycytidine triphosphate deaminase  50 
 
 
207 aa  62.4  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000608448  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1899  deoxycytidine triphosphate deaminase  51.79 
 
 
199 aa  61.6  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.234563  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0395  2-deoxycytidine 5-triphosphate deaminase  46.43 
 
 
193 aa  53.1  0.000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.610625  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35480  dCTP deaminase  43.4 
 
 
191 aa  44.3  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2794  dCTP deaminase  31.94 
 
 
195 aa  43.9  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3189  deoxycytidine triphosphate deaminase  39.62 
 
 
191 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2932  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.33 
 
 
196 aa  41.6  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0890  deoxycytidine triphosphate deaminase  41.51 
 
 
191 aa  41.2  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0244  deoxycytidine triphosphate deaminase  41.51 
 
 
191 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2441  deoxycytidine triphosphate deaminase  39.22 
 
 
194 aa  40.4  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.145517 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>