13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3894 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3894  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 		 245 aa  502  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.795843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3530  hypothetical protein  46.8 
 
 		 250 aa  188  7e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3969  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  55.74 
 
 		 232 aa  119  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5089  hypothetical protein  42.05 
 
 		 170 aa  119  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.463283 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0528  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.58 
 
 		 334 aa  118  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3067  hypothetical protein  37.35 
 
 		 200 aa  87.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000353502 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4582  hypothetical protein  37.35 
 
 		 200 aa  87.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.90708  decreased coverage  0.000189662 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5197  hypothetical protein  35.47 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5184  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  40.24 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0085  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.1 
 
 		 143 aa  46.6  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0267  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.61 
 
 		 317 aa  43.5  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.06 
 
 		 300 aa  42.4  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230692  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0478  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.89 
 
 		 471 aa  42  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.298298  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>