10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6522 on replicon NC_009622
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009622  Smed_6522  hypothetical protein  100 
 
 		 1157 aa  2362    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0162687  normal  0.104781 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0565  hypothetical protein  26.15 
 
 		 1159 aa  250  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3739  hypothetical protein  23.14 
 
 		 1140 aa  239  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.0363234 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1099  hypothetical protein  24.27 
 
 		 1156 aa  218  5e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4624  hypothetical protein  23.09 
 
 		 955 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.447848  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0544  hypothetical protein  21.35 
 
 		 1187 aa  152  5e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.503058  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6156  hypothetical protein  23.3 
 
 		 1034 aa  134  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0303  hypothetical protein  21.56 
 
 		 1091 aa  98.6  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0198659  decreased coverage  0.0000318594 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3242  hypothetical protein  21.56 
 
 		 1107 aa  79  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4625  hypothetical protein  22.84 
 
 		 181 aa  53.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>