10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6019 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_6019    100 
 
 		 749 bp  1485    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0229369 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0744  integrase catalytic subunit  84.62 
 
 		 1182 bp  79.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4005  integrase catalytic region  96.77 
 
 		 855 bp  54  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.5936 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3869    85.96 
 
 		 982 bp  50.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3888    85.96 
 
 		 955 bp  50.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4471  integrase catalytic region  91.67 
 
 		 708 bp  48.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.154485  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5317  integrase catalytic region  91.67 
 
 		 921 bp  48.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0707814  normal  0.862383 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4559  Integrase catalytic region  91.67 
 
 		 930 bp  48.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.326011 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4981  Integrase catalytic region  91.67 
 
 		 930 bp  48.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0674  Integrase catalytic region  91.67 
 
 		 930 bp  48.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125521  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>