22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3950 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3950  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  237  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2151  hypothetical protein  67.78 
 
 		 121 aa  136  8.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.382663  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1767  hypothetical protein  67.78 
 
 		 122 aa  136  8.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.282403  normal  0.949113 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1815  hypothetical protein  67.78 
 
 		 109 aa  136  8.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.778165 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5770  hypothetical protein  67.78 
 
 		 121 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.338294  normal  0.593625 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2350  hypothetical protein  54.7 
 
 		 112 aa  132  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.565165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0469  hypothetical protein  58 
 
 		 116 aa  131  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5986  hypothetical protein  63.33 
 
 		 121 aa  131  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0392557  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0514  hypothetical protein  65.56 
 
 		 120 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.814448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2595  hypothetical protein  61.86 
 
 		 167 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.991333  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1253  hypothetical protein  61.86 
 
 		 163 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00971049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1928  hypothetical protein  60.82 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.114348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5954  hypothetical protein  52.29 
 
 		 119 aa  124  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0997435 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1797  hypothetical protein  58.89 
 
 		 117 aa  123  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00633106  normal  0.777941 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1588  hypothetical protein  57.14 
 
 		 127 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.102839 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6488  hypothetical protein  40.95 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674936  normal  0.29434 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4971  hypothetical protein  46.97 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3398  hypothetical protein  31.87 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0214553 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1947  hypothetical protein  38.24 
 
 		 154 aa  52.8  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2437  hypothetical protein  32 
 
 		 135 aa  52  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3110  hypothetical protein  27.96 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3044  hypothetical protein  32.63 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.274335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>