22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1947 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1947  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  320  6e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4971  hypothetical protein  37.89 
 
 
116 aa  76.3  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3398  hypothetical protein  34.48 
 
 
130 aa  75.5  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0214553 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1588  hypothetical protein  34.41 
 
 
127 aa  69.7  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.102839 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6488  hypothetical protein  40.45 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674936  normal  0.29434 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2595  hypothetical protein  35.56 
 
 
167 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.991333  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2437  hypothetical protein  36.46 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1253  hypothetical protein  35.56 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00971049  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1928  hypothetical protein  35.48 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.114348  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3110  hypothetical protein  35.16 
 
 
121 aa  65.1  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1797  hypothetical protein  36.26 
 
 
117 aa  64.3  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00633106  normal  0.777941 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3044  hypothetical protein  37.36 
 
 
108 aa  63.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.274335  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0469  hypothetical protein  32.97 
 
 
116 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2350  hypothetical protein  28.57 
 
 
112 aa  61.6  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.565165  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3950  hypothetical protein  35.16 
 
 
117 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5954  hypothetical protein  30.61 
 
 
119 aa  56.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0997435 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5770  hypothetical protein  32.97 
 
 
121 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.338294  normal  0.593625 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5986  hypothetical protein  28.87 
 
 
121 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0392557  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2151  hypothetical protein  30.77 
 
 
121 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.382663  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1815  hypothetical protein  30.77 
 
 
109 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.778165 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0514  hypothetical protein  30.77 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.814448  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1767  hypothetical protein  29.67 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.282403  normal  0.949113 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>