22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0469 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0469  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  232  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2350  hypothetical protein  62.77 
 
 		 112 aa  132  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.565165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3950  hypothetical protein  58 
 
 		 117 aa  131  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1767  hypothetical protein  60 
 
 		 122 aa  120  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.282403  normal  0.949113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5986  hypothetical protein  61.11 
 
 		 121 aa  120  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0392557  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2151  hypothetical protein  60 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.382663  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5770  hypothetical protein  61.11 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.338294  normal  0.593625 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0514  hypothetical protein  61.11 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.814448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1815  hypothetical protein  60 
 
 		 109 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.778165 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1797  hypothetical protein  61.11 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00633106  normal  0.777941 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2595  hypothetical protein  61.29 
 
 		 167 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.991333  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1253  hypothetical protein  61.29 
 
 		 163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00971049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5954  hypothetical protein  50.44 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0997435 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1928  hypothetical protein  59.14 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.114348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1588  hypothetical protein  56.04 
 
 		 127 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.102839 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3110  hypothetical protein  35.48 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3398  hypothetical protein  33.04 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0214553 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6488  hypothetical protein  40 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674936  normal  0.29434 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4971  hypothetical protein  33.33 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2437  hypothetical protein  35.23 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3044  hypothetical protein  30.56 
 
 		 108 aa  57  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.274335  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1947  hypothetical protein  32.97 
 
 		 154 aa  53.5  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>