23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3872 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3872  peptidase C45 acyl-coenzyme A:6-aminopenicillanic acid acyl-transferase  100 
 
 		 346 aa  714    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1721  peptidase C45 acyl-coenzyme A:6- aminopenicillanic acid acyl-transferase  38.97 
 
 		 328 aa  190  4e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00157211  normal  0.132726 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4957  peptidase C45 acyl-coenzyme A:6- aminopenicillanic acid acyl-transferase  36.34 
 
 		 361 aa  172  9e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2394  hypothetical protein  25.42 
 
 		 374 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2015  hypothetical protein  31.61 
 
 		 370 aa  62.8  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.451565  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1982  hypothetical protein  31.61 
 
 		 370 aa  62.8  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1469  hypothetical protein  32.26 
 
 		 346 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000286435  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2466  hypothetical protein  28.11 
 
 		 374 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91653  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2186  hypothetical protein  24.26 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.181008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2229  hypothetical protein  24.26 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0133638  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2531  hypothetical protein  24.26 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00367903  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2437  hypothetical protein  24.26 
 
 		 374 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.285693  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2269  hypothetical protein  24.26 
 
 		 374 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2453  hypothetical protein  23.83 
 
 		 374 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4392  peptidase C45 acyl-coenzyme A:6-aminopenicillanic acid acyl-transferase  26.55 
 
 		 322 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0332  choloylglycine hydrolase  30.3 
 
 		 335 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0499  hypothetical protein  34.85 
 
 		 326 aa  50.8  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1168  peptidase C45 acyl-coenzyme A:6- aminopenicillanic acid acyl-transferase  23.84 
 
 		 328 aa  49.7  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3984  peptidase C45 acyl-coenzyme A:6-aminopenicillanic acid acyl-transferase  25.53 
 
 		 372 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1745  Choloylglycine hydrolase  30 
 
 		 350 aa  47.8  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1920  choloylglycine hydrolase  25.99 
 
 		 356 aa  42.7  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0155  hypothetical protein  34.65 
 
 		 408 aa  42.7  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0164  hypothetical protein  34.65 
 
 		 408 aa  42.7  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.136882  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>