34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2214 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_2214  aminoglycoside N(3')-acetyltransferase  100 
 
 
263 aa  538  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22977  normal  0.57949 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4195  Aminoglycoside N(3')-acetyltransferase  52.05 
 
 
259 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.364362  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2939  aminoglycoside N3-acetyltransferase  33.87 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.582412  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2306  aminoglycoside N3-acetyltransferase  33.06 
 
 
267 aa  132  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0406695  hitchhiker  0.000000000000570202 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2969  aminoglycoside N3-acetyltransferase  34.41 
 
 
267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0404364  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2651  aminoglycoside N3'-acetyltransferase  34.41 
 
 
267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2673  aminoglycoside N3'-acetyltransferase  34.41 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2929  aminoglycoside N3-acetyltransferase  33.6 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.20696e-29 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2930  aminoglycoside N3-acetyltransferase  34.01 
 
 
265 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.520784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2722  aminoglycoside N3-acetyltransferase  34.01 
 
 
267 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2976  aminoglycoside N3-acetyltransferase  33.6 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.128995  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2727  aminoglycoside N(3')-acetyltransferase  32.13 
 
 
266 aa  125  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00123076  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2002  aminoglycoside N(3')-acetyltransferase  31.73 
 
 
269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.490675  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3405  Aminoglycoside N(3')-acetyltransferase  32.26 
 
 
268 aa  94  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.393623  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0724  Aminoglycoside N(3')-acetyltransferase  28.69 
 
 
265 aa  89.4  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0513  Aminoglycoside N(3')-acetyltransferase  36.36 
 
 
283 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0145  aminoglycoside 3-N-acetyltransferase  29.92 
 
 
300 aa  86.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.225665  normal 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D33  aminoglycoside N3'-acetyltransferase  24.6 
 
 
276 aa  82  0.000000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.327178  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2653  aminoglycoside N(3')-acetyltransferase  30.04 
 
 
283 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884178 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0391  Aminoglycoside N(3')-acetyltransferase  34.27 
 
 
287 aa  80.1  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.983189  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0547  aminoglycoside 3-N-acetyltransferase  38.04 
 
 
190 aa  77  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3154  aminoglycoside N(3')-acetyltransferase  28.62 
 
 
277 aa  74.3  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.571905  normal  0.77429 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5177  aminoglycoside 3-N-acetyltransferase  27.87 
 
 
270 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.777652  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3033  Aminoglycoside N(3')-acetyltransferase  28.57 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.280812  normal  0.39369 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1202  aminoglycoside 3-N-acetyltransferase  29.1 
 
 
266 aa  67.4  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3617  aminoglycoside N3'-acetyltransferase-like protein  23.4 
 
 
267 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000156186  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1039  aminoglycoside N3'-acetyltransferase  25 
 
 
272 aa  65.9  0.0000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1157  aminoglycoside N3'-acetyltransferase-like protein  31.82 
 
 
308 aa  64.7  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.586227 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1488  hypothetical protein  24.54 
 
 
261 aa  54.7  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1463  hypothetical protein  23.64 
 
 
260 aa  53.1  0.000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0113  hypothetical protein  29.79 
 
 
285 aa  48.5  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000635309 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1301  hypothetical protein  24.42 
 
 
260 aa  47  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0426  hypothetical protein  25.15 
 
 
263 aa  44.7  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0144  aminoglycoside N3'-acetyltransferase  23.53 
 
 
261 aa  44.3  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000196554 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>