30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3154 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008687  Pden_3154  aminoglycoside N(3')-acetyltransferase  100 
 
 
277 aa  556  1e-157  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.571905  normal  0.77429 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0145  aminoglycoside 3-N-acetyltransferase  50.38 
 
 
300 aa  251  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.225665  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5177  aminoglycoside 3-N-acetyltransferase  37.65 
 
 
270 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.777652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2929  aminoglycoside N3-acetyltransferase  30.4 
 
 
267 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.20696e-29 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2651  aminoglycoside N3'-acetyltransferase  30.4 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2976  aminoglycoside N3-acetyltransferase  31.5 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.128995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2673  aminoglycoside N3'-acetyltransferase  30.4 
 
 
267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2722  aminoglycoside N3-acetyltransferase  30.04 
 
 
267 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2930  aminoglycoside N3-acetyltransferase  30.04 
 
 
265 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.520784  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2969  aminoglycoside N3-acetyltransferase  30.04 
 
 
267 aa  115  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0404364  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2306  aminoglycoside N3-acetyltransferase  28.57 
 
 
267 aa  112  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0406695  hitchhiker  0.000000000000570202 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2939  aminoglycoside N3-acetyltransferase  28.57 
 
 
267 aa  112  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.582412  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2727  aminoglycoside N(3')-acetyltransferase  29.7 
 
 
266 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00123076  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0724  Aminoglycoside N(3')-acetyltransferase  36.33 
 
 
265 aa  107  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2002  aminoglycoside N(3')-acetyltransferase  28.25 
 
 
269 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.490675  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3033  Aminoglycoside N(3')-acetyltransferase  34.32 
 
 
268 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.280812  normal  0.39369 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0391  Aminoglycoside N(3')-acetyltransferase  37.67 
 
 
287 aa  98.2  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.983189  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0513  Aminoglycoside N(3')-acetyltransferase  33.09 
 
 
283 aa  89.4  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3405  Aminoglycoside N(3')-acetyltransferase  31.7 
 
 
268 aa  88.2  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.393623  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4195  Aminoglycoside N(3')-acetyltransferase  30.8 
 
 
259 aa  79  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.364362  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2653  aminoglycoside N(3')-acetyltransferase  37.77 
 
 
283 aa  77  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884178 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1039  aminoglycoside N3'-acetyltransferase  26.83 
 
 
272 aa  74.7  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3617  aminoglycoside N3'-acetyltransferase-like protein  29.5 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000156186  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0547  aminoglycoside 3-N-acetyltransferase  37.74 
 
 
190 aa  70.5  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2214  aminoglycoside N(3')-acetyltransferase  28.14 
 
 
263 aa  62  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22977  normal  0.57949 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D33  aminoglycoside N3'-acetyltransferase  27.07 
 
 
276 aa  61.6  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.327178  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1202  aminoglycoside 3-N-acetyltransferase  32.02 
 
 
266 aa  58.5  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1157  aminoglycoside N3'-acetyltransferase-like protein  30.32 
 
 
308 aa  54.3  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.586227 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1315  hypothetical protein  24.4 
 
 
239 aa  45.8  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0144  aminoglycoside N3'-acetyltransferase  21.59 
 
 
261 aa  45.4  0.0009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000196554 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>