28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1301 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_1301  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  531  1e-150  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1488  hypothetical protein  66.15 
 
 
261 aa  342  5e-93  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0426  hypothetical protein  63.39 
 
 
263 aa  326  2.0000000000000001e-88  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1463  hypothetical protein  52.71 
 
 
260 aa  269  2.9999999999999997e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1315  hypothetical protein  51.48 
 
 
239 aa  255  6e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1309  hypothetical protein  86.92 
 
 
110 aa  194  9e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000694213  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1310  hypothetical protein  56.64 
 
 
164 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000462358  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1502  aminoglycoside N3-acetyltransferase domain-containing protein  53.33 
 
 
110 aa  107  1e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.646721  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0144  aminoglycoside N3'-acetyltransferase  33.64 
 
 
261 aa  95.5  8e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000196554 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4195  Aminoglycoside N(3')-acetyltransferase  29.09 
 
 
259 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.364362  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3033  Aminoglycoside N(3')-acetyltransferase  22.81 
 
 
268 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.280812  normal  0.39369 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0547  aminoglycoside 3-N-acetyltransferase  27.94 
 
 
190 aa  57.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D33  aminoglycoside N3'-acetyltransferase  29.13 
 
 
276 aa  54.7  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.327178  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0145  aminoglycoside 3-N-acetyltransferase  20.78 
 
 
300 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.225665  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2976  aminoglycoside N3-acetyltransferase  29.85 
 
 
267 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.128995  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3405  Aminoglycoside N(3')-acetyltransferase  25.69 
 
 
268 aa  51.6  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.393623  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2002  aminoglycoside N(3')-acetyltransferase  28.89 
 
 
269 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.490675  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1157  aminoglycoside N3'-acetyltransferase-like protein  23.5 
 
 
308 aa  50.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.586227 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2651  aminoglycoside N3'-acetyltransferase  28.8 
 
 
267 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2673  aminoglycoside N3'-acetyltransferase  27.2 
 
 
267 aa  49.7  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2727  aminoglycoside N(3')-acetyltransferase  28.8 
 
 
266 aa  49.3  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00123076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2930  aminoglycoside N3-acetyltransferase  28.8 
 
 
265 aa  49.3  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.520784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2722  aminoglycoside N3-acetyltransferase  27.2 
 
 
267 aa  49.3  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2929  aminoglycoside N3-acetyltransferase  27.2 
 
 
267 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.20696e-29 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2306  aminoglycoside N3-acetyltransferase  28.93 
 
 
267 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0406695  hitchhiker  0.000000000000570202 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2939  aminoglycoside N3-acetyltransferase  28.1 
 
 
267 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.582412  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2969  aminoglycoside N3-acetyltransferase  26.12 
 
 
267 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0404364  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3617  aminoglycoside N3'-acetyltransferase-like protein  27.65 
 
 
267 aa  46.2  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000156186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>