33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0826 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0826  ubiquinol-cytochrome C chaperone  100 
 
 		 178 aa  357  4e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.62214  normal  0.144248 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1194  Ubiquinol-cytochrome C chaperone  63.22 
 
 		 187 aa  223  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1626  hypothetical protein  63.07 
 
 		 184 aa  220  7e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.648306  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1283  Ubiquinol-cytochrome C chaperone  63.79 
 
 		 177 aa  216  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.997258  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0773  hypothetical protein  50.59 
 
 		 184 aa  144  7.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0766  hypothetical protein  50.59 
 
 		 184 aa  144  7.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2522  ubiquinol-cytochrome C chaperone  50 
 
 		 195 aa  140  9e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0708035  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1143  ubiquinol-cytochrome C chaperone  48.15 
 
 		 182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2326  ubiquinol-cytochrome c chaperone  43.42 
 
 		 188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0709911  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2051  ubiquinol-cytochrome c chaperone  43.05 
 
 		 188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.616544  normal  0.410298 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7078  Ubiquinol-cytochrome C chaperone  49.15 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196662  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3971  ubiquinol-cytochrome c chaperone  50 
 
 		 189 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848511 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2920  ubiquinol-cytochrome C chaperone  39.87 
 
 		 193 aa  107  8.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00172596 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6227  ubiquinol-cytochrome c chaperone  48.18 
 
 		 182 aa  103  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0452422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2683  ubiquinol-cytochrome C chaperone  42.68 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326519  normal  0.940545 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2012  Ubiquinol-cytochrome C chaperone  44.37 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2647  ubiquinol-cytochrome C chaperone  42.04 
 
 		 179 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622103  normal  0.0632378 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0655  ubiquinol-cytochrome c chaperone  37.93 
 
 		 175 aa  99  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00921901 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3017  Ubiquinol-cytochrome C chaperone  43.04 
 
 		 178 aa  98.6  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4634  hypothetical protein  39.73 
 
 		 181 aa  97.8  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3382  ubiquinol-cytochrome c chaperone  39.16 
 
 		 201 aa  97.8  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.095494 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1583  ubiquinol-cytochrome C chaperone  37.29 
 
 		 179 aa  95.1  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1525  ubiquinol-cytochrome C chaperone  39.87 
 
 		 178 aa  94.4  7e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000222638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2673  ubiquinol-cytochrome C chaperone  37.42 
 
 		 183 aa  92.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0813715  normal  0.833176 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4382  ubiquinol-cytochrome C chaperone  42.07 
 
 		 201 aa  90.1  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1404  ubiquinol-cytochrome C chaperone  39.23 
 
 		 207 aa  90.5  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.412319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1930  hypothetical protein  36.77 
 
 		 173 aa  85.9  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3036  hypothetical protein  32.91 
 
 		 176 aa  80.9  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.9106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1663  ubiquinol-cytochrome C chaperone  34.55 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2637  hypothetical protein  33.33 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2794  CBP3 protein  37.93 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.359671  normal  0.314397 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6927  predicted protein  31.18 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00254718  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1887  hypothetical protein  35.23 
 
 		 187 aa  47.8  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0281497  normal  0.51761 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>