32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2012 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2012  Ubiquinol-cytochrome C chaperone  100 
 
 		 189 aa  364  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2051  ubiquinol-cytochrome c chaperone  84.66 
 
 		 188 aa  280  6.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.616544  normal  0.410298 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2326  ubiquinol-cytochrome c chaperone  84.66 
 
 		 188 aa  279  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0709911  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7078  Ubiquinol-cytochrome C chaperone  68.93 
 
 		 183 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196662  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3971  ubiquinol-cytochrome c chaperone  69.4 
 
 		 189 aa  170  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848511 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6227  ubiquinol-cytochrome c chaperone  68.36 
 
 		 182 aa  167  9e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0452422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3382  ubiquinol-cytochrome c chaperone  44.21 
 
 		 201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.095494 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2683  ubiquinol-cytochrome C chaperone  47.85 
 
 		 179 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326519  normal  0.940545 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1583  ubiquinol-cytochrome C chaperone  45.09 
 
 		 179 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1404  ubiquinol-cytochrome C chaperone  46.45 
 
 		 207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.412319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2647  ubiquinol-cytochrome C chaperone  48.12 
 
 		 179 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622103  normal  0.0632378 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0655  ubiquinol-cytochrome c chaperone  48.3 
 
 		 175 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00921901 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3017  Ubiquinol-cytochrome C chaperone  47.85 
 
 		 178 aa  124  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1194  Ubiquinol-cytochrome C chaperone  43.12 
 
 		 187 aa  124  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1283  Ubiquinol-cytochrome C chaperone  47.01 
 
 		 177 aa  122  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.997258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2673  ubiquinol-cytochrome C chaperone  47.27 
 
 		 183 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0813715  normal  0.833176 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1626  hypothetical protein  40.66 
 
 		 184 aa  122  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.648306  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1143  ubiquinol-cytochrome C chaperone  49.13 
 
 		 182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0826  ubiquinol-cytochrome C chaperone  43.4 
 
 		 178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.62214  normal  0.144248 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0766  hypothetical protein  49.63 
 
 		 184 aa  108  6e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0773  hypothetical protein  49.63 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1525  ubiquinol-cytochrome C chaperone  42.46 
 
 		 178 aa  107  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000222638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4382  ubiquinol-cytochrome C chaperone  46.15 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2522  ubiquinol-cytochrome C chaperone  48.89 
 
 		 195 aa  102  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0708035  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4634  hypothetical protein  42.34 
 
 		 181 aa  101  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2920  ubiquinol-cytochrome C chaperone  38.41 
 
 		 193 aa  95.1  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00172596 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3036  hypothetical protein  39.6 
 
 		 176 aa  93.2  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.9106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1663  ubiquinol-cytochrome C chaperone  35.38 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2637  hypothetical protein  37.96 
 
 		 172 aa  77  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2794  CBP3 protein  36.54 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.359671  normal  0.314397 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1930  hypothetical protein  33.14 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6927  predicted protein  31.82 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00254718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>