31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2637 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2637  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  341  2.9999999999999997e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1930  hypothetical protein  44.72 
 
 
173 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2794  CBP3 protein  52.59 
 
 
176 aa  124  6e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.359671  normal  0.314397 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2673  ubiquinol-cytochrome C chaperone  38.81 
 
 
183 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0813715  normal  0.833176 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2647  ubiquinol-cytochrome C chaperone  43.61 
 
 
179 aa  85.9  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622103  normal  0.0632378 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2683  ubiquinol-cytochrome C chaperone  41.01 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326519  normal  0.940545 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1525  ubiquinol-cytochrome C chaperone  35.5 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000222638  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1583  ubiquinol-cytochrome C chaperone  40.67 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4634  hypothetical protein  40 
 
 
181 aa  77.8  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1404  ubiquinol-cytochrome C chaperone  41.86 
 
 
207 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.412319  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1626  hypothetical protein  35.38 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.648306  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3017  Ubiquinol-cytochrome C chaperone  34.76 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2920  ubiquinol-cytochrome C chaperone  37.31 
 
 
193 aa  75.1  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00172596 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2326  ubiquinol-cytochrome c chaperone  39.68 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0709911  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2051  ubiquinol-cytochrome c chaperone  39.68 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.616544  normal  0.410298 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1283  Ubiquinol-cytochrome C chaperone  32.31 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.997258  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1194  Ubiquinol-cytochrome C chaperone  31.54 
 
 
187 aa  68.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0826  ubiquinol-cytochrome C chaperone  33.33 
 
 
178 aa  66.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.62214  normal  0.144248 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0766  hypothetical protein  33.33 
 
 
184 aa  65.9  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7078  Ubiquinol-cytochrome C chaperone  38.14 
 
 
183 aa  64.3  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196662  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3382  ubiquinol-cytochrome c chaperone  34.11 
 
 
201 aa  64.3  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.095494 
 
 
-
 
NC_004310  BR0773  hypothetical protein  33.33 
 
 
184 aa  64.3  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1143  ubiquinol-cytochrome C chaperone  36.92 
 
 
182 aa  64.3  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3036  hypothetical protein  31.61 
 
 
176 aa  63.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.9106  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0655  ubiquinol-cytochrome c chaperone  33.58 
 
 
175 aa  63.2  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00921901 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2522  ubiquinol-cytochrome C chaperone  34.09 
 
 
195 aa  62.4  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0708035  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2012  Ubiquinol-cytochrome C chaperone  38.66 
 
 
189 aa  60.8  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4382  ubiquinol-cytochrome C chaperone  39.02 
 
 
201 aa  60.1  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3971  ubiquinol-cytochrome c chaperone  38.14 
 
 
189 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848511 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6227  ubiquinol-cytochrome c chaperone  39.09 
 
 
182 aa  58.2  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0452422  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1663  ubiquinol-cytochrome C chaperone  33.11 
 
 
202 aa  56.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>