33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2097 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2097  RebB protein  100 
 
 
89 aa  169  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0323054 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2099  RebB protein  79.55 
 
 
90 aa  143  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.5081  normal  0.0549517 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3151  RebB protein  81.61 
 
 
98 aa  141  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3150  RebB protein  80.9 
 
 
92 aa  140  4e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3149  RebB protein  75.58 
 
 
88 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2096  RebB protein  90.8 
 
 
96 aa  125  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.887295  normal  0.0193954 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2098  RebA protein  84.09 
 
 
88 aa  122  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0527054 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0458  RebB protein  86.57 
 
 
73 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3360  putative RebB protein  86.57 
 
 
73 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0274  putative RebB protein  86.57 
 
 
73 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2104  putative RebB protein  86.57 
 
 
73 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2988  putative RebB protein  86.57 
 
 
73 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.898476  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3319  RebB protein, putative  86.57 
 
 
73 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0261  putative RebB protein  86.57 
 
 
73 aa  114  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.38666  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3148  RebB protein  66.28 
 
 
88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27640  putative protein associated with synthesis and assembly of refractile inclusion bodies  53.49 
 
 
106 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127306  decreased coverage  0.00158217 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01623  RebB protein  54.55 
 
 
106 aa  79  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27630  putative protein associated with synthesis and assembly of refractile inclusion bodies  50 
 
 
106 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.333652  decreased coverage  0.00161051 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3004  RebB protein  61.97 
 
 
84 aa  75.9  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000250436 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0794  hypothetical protein  63.24 
 
 
118 aa  74.7  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00595695 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6980  hypothetical protein  48.57 
 
 
107 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1238  hypothetical protein  43.75 
 
 
111 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308563  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1213  hypothetical protein  46.48 
 
 
107 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1240  hypothetical protein  46.48 
 
 
107 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.430175  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1211  hypothetical protein  43.75 
 
 
110 aa  57  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6978  hypothetical protein  43.75 
 
 
110 aa  57  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.569819  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1239  hypothetical protein  45.68 
 
 
122 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.164758  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1212  hypothetical protein  43.9 
 
 
122 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6979  hypothetical protein  45.68 
 
 
128 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.794643  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6983  hypothetical protein  39.13 
 
 
126 aa  47.8  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.686236 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1216  hypothetical protein  36.23 
 
 
105 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1243  hypothetical protein  36.23 
 
 
101 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317441  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3147  hypothetical protein  38.1 
 
 
161 aa  44.7  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.887391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>