33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3150 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3150  RebB protein  100 
 
 		 92 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3151  RebB protein  94.25 
 
 		 98 aa  159  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3149  RebB protein  80.23 
 
 		 88 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2099  RebB protein  74.71 
 
 		 90 aa  127  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.5081  normal  0.0549517 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2097  RebB protein  80.9 
 
 		 89 aa  123  9e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0323054 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2096  RebB protein  80.9 
 
 		 96 aa  115  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.887295  normal  0.0193954 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3148  RebB protein  68.6 
 
 		 88 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2098  RebA protein  72.73 
 
 		 88 aa  107  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0527054 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0261  putative RebB protein  77.61 
 
 		 73 aa  103  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.38666  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0458  RebB protein  77.61 
 
 		 73 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3360  putative RebB protein  77.61 
 
 		 73 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0274  putative RebB protein  77.61 
 
 		 73 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2104  putative RebB protein  77.61 
 
 		 73 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2988  putative RebB protein  77.61 
 
 		 73 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.898476  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3319  RebB protein, putative  77.61 
 
 		 73 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27640  putative protein associated with synthesis and assembly of refractile inclusion bodies  50 
 
 		 106 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127306  decreased coverage  0.00158217 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01623  RebB protein  46.74 
 
 		 106 aa  77.8  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27630  putative protein associated with synthesis and assembly of refractile inclusion bodies  51.11 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.333652  decreased coverage  0.00161051 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3004  RebB protein  57.75 
 
 		 84 aa  74.7  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000250436 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0794  hypothetical protein  58.82 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00595695 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6980  hypothetical protein  50 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1211  hypothetical protein  47.5 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1238  hypothetical protein  47.5 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1213  hypothetical protein  46.48 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6978  hypothetical protein  47.5 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.569819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1240  hypothetical protein  46.48 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.430175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6979  hypothetical protein  46.34 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.794643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1212  hypothetical protein  42.86 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1239  hypothetical protein  43.96 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.164758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6983  hypothetical protein  42.25 
 
 		 126 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.686236 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1216  hypothetical protein  48.08 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1243  hypothetical protein  48.08 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3147  hypothetical protein  45.76 
 
 		 161 aa  44.7  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.887391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>