16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3147 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3147  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  320  4e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.887391  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2101  hypothetical protein  47.06 
 
 		 194 aa  60.8  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604396 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3150  RebB protein  45.76 
 
 		 92 aa  44.7  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3151  RebB protein  45.76 
 
 		 98 aa  44.3  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3319  RebB protein, putative  44.64 
 
 		 73 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0458  RebB protein  44.64 
 
 		 73 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3148  RebB protein  41.67 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2988  putative RebB protein  44.64 
 
 		 73 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.898476  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2104  putative RebB protein  44.64 
 
 		 73 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0261  putative RebB protein  44.64 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.38666  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0274  putative RebB protein  44.64 
 
 		 73 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3360  putative RebB protein  44.64 
 
 		 73 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27640  putative protein associated with synthesis and assembly of refractile inclusion bodies  32.1 
 
 		 106 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127306  decreased coverage  0.00158217 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2099  RebB protein  44.23 
 
 		 90 aa  41.6  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.5081  normal  0.0549517 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2097  RebB protein  38.1 
 
 		 89 aa  41.2  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0323054 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3149  RebB protein  34.72 
 
 		 88 aa  40.4  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>