17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1703 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1703  hypothetical protein  100 
 
 
80 aa  168  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1263  hypothetical protein  68.83 
 
 
91 aa  127  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.576583  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1466  hypothetical protein  68.83 
 
 
91 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0844063  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0496  hypothetical protein  68.83 
 
 
92 aa  127  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2020  hypothetical protein  65 
 
 
91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3483  hypothetical protein  66.23 
 
 
91 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1131  hypothetical protein  66.23 
 
 
89 aa  121  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2947  hypothetical protein  67.11 
 
 
86 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.46263  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5686  hypothetical protein  63.89 
 
 
86 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1359  hypothetical protein  56.41 
 
 
81 aa  103  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0337456  hitchhiker  0.00758752 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2488  hypothetical protein  55.26 
 
 
88 aa  103  7e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.213647  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0793  hypothetical protein  56.96 
 
 
86 aa  99.8  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.276266 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3697  hypothetical protein  43.24 
 
 
85 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0219  hypothetical protein  47.22 
 
 
76 aa  63.9  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.762197  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3862  hypothetical protein  40.58 
 
 
74 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.612407 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0102  hypothetical protein  33.33 
 
 
83 aa  41.6  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.14396e-73  hitchhiker  5.10513e-129 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0182  hypothetical protein  34.21 
 
 
87 aa  40.8  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833005  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>