15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3697 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3697  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  178  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0793  hypothetical protein  48.78 
 
 		 86 aa  79.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.276266 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5686  hypothetical protein  43.04 
 
 		 86 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0219  hypothetical protein  46.05 
 
 		 76 aa  75.9  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.762197  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3483  hypothetical protein  47.3 
 
 		 91 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2488  hypothetical protein  42.68 
 
 		 88 aa  73.6  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.213647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1263  hypothetical protein  50.67 
 
 		 91 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.576583  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2020  hypothetical protein  45.95 
 
 		 91 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1131  hypothetical protein  46.51 
 
 		 89 aa  72  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0496  hypothetical protein  49.33 
 
 		 92 aa  71.2  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1703  hypothetical protein  43.24 
 
 		 80 aa  70.5  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1466  hypothetical protein  46.51 
 
 		 91 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0844063  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2947  hypothetical protein  45.95 
 
 		 86 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.46263  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1359  hypothetical protein  44.87 
 
 		 81 aa  67  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0337456  hitchhiker  0.00758752 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0102  hypothetical protein  41.1 
 
 		 83 aa  51.6  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.14396e-73  hitchhiker  5.10513e-129 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>